MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Geobacillus thermoglucosidasius C56-YS93 plasmid pGEOTH02

Total Repeats: 477

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015661	GTTA	2	8	91	98	25 %	50 %	25 %	0 %	336237225
2	NC_015661	AAC	2	6	109	114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336237225
3	NC_015661	TGA	2	6	119	124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336237225
4	NC_015661	GAA	2	6	199	204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336237225
5	NC_015661	TAT	2	6	219	224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336237225
6	NC_015661	T	6	6	244	249	0 %	100 %	0 %	0 %	336237225
7	NC_015661	GCT	2	6	252	257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336237225
8	NC_015661	A	6	6	288	293	100 %	0 %	0 %	0 %	336237225
9	NC_015661	GAGG	2	8	312	319	25 %	0 %	75 %	0 %	336237225
10	NC_015661	T	7	7	320	326	0 %	100 %	0 %	0 %	336237225
11	NC_015661	GGC	2	6	330	335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336237225
12	NC_015661	AC	3	6	359	364	50 %	0 %	0 %	50 %	336237225
13	NC_015661	TTA	2	6	403	408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336237225
14	NC_015661	ACA	2	6	412	417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336237225
15	NC_015661	ATG	2	6	425	430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336237225
16	NC_015661	AGA	2	6	469	474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336237225
17	NC_015661	T	8	8	484	491	0 %	100 %	0 %	0 %	336237225
18	NC_015661	CAA	2	6	515	520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336237225
19	NC_015661	ACA	2	6	551	556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336237225
20	NC_015661	ATT	2	6	567	572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336237225
21	NC_015661	GAA	2	6	586	591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336237225
22	NC_015661	TAAA	2	8	671	678	75 %	25 %	0 %	0 %	336237225
23	NC_015661	AG	3	6	767	772	50 %	0 %	50 %	0 %	336237225
24	NC_015661	CTAT	2	8	781	788	25 %	50 %	0 %	25 %	336237225
25	NC_015661	TAAG	2	8	845	852	50 %	25 %	25 %	0 %	336237225
26	NC_015661	TGC	2	6	867	872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336237225
27	NC_015661	TTC	2	6	887	892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336237225
28	NC_015661	AGG	2	6	978	983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336237225
29	NC_015661	A	6	6	985	990	100 %	0 %	0 %	0 %	336237225
30	NC_015661	A	6	6	1039	1044	100 %	0 %	0 %	0 %	336237225
31	NC_015661	GAA	2	6	1087	1092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336237225
32	NC_015661	GAA	2	6	1097	1102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336237225
33	NC_015661	A	7	7	1118	1124	100 %	0 %	0 %	0 %	336237225
34	NC_015661	AGA	2	6	1209	1214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336237225
35	NC_015661	ATA	2	6	1236	1241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336237225
36	NC_015661	TCC	2	6	1254	1259	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_015661	TTG	2	6	1292	1297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336237226
38	NC_015661	CAAG	2	8	1302	1309	50 %	0 %	25 %	25 %	336237226
39	NC_015661	ATC	2	6	1324	1329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336237226
40	NC_015661	CTT	2	6	1332	1337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336237226
41	NC_015661	TCT	2	6	1385	1390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336237226
42	NC_015661	TCA	2	6	1436	1441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336237226
43	NC_015661	TCCTCT	2	12	1523	1534	0 %	50 %	0 %	50 %	336237226
44	NC_015661	CAT	2	6	1549	1554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336237226
45	NC_015661	AAT	2	6	1562	1567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336237226
46	NC_015661	CTC	2	6	1691	1696	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_015661	A	6	6	1703	1708	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015661	ACACC	2	10	1710	1719	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
49	NC_015661	TTA	2	6	1757	1762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015661	ATAA	2	8	1808	1815	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015661	TTCC	2	8	1851	1858	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_015661	A	6	6	1868	1873	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015661	C	6	6	1903	1908	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
54	NC_015661	A	7	7	1930	1936	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015661	T	6	6	1937	1942	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015661	AAC	2	6	1964	1969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_015661	T	7	7	1988	1994	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015661	GGA	2	6	1999	2004	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015661	GTCT	2	8	2024	2031	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_015661	CGAA	2	8	2034	2041	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_015661	ACA	2	6	2076	2081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_015661	CAC	2	6	2111	2116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_015661	TCC	2	6	2142	2147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_015661	CTT	2	6	2164	2169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_015661	AC	4	8	2189	2196	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_015661	ATA	2	6	2216	2221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015661	CA	3	6	2234	2239	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_015661	A	7	7	2285	2291	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015661	TC	3	6	2298	2303	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_015661	ACA	2	6	2304	2309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_015661	CT	3	6	2322	2327	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_015661	C	6	6	2338	2343	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
73	NC_015661	TCCA	2	8	2364	2371	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_015661	ATT	2	6	2399	2404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015661	A	7	7	2440	2446	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015661	T	6	6	2553	2558	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015661	AT	3	6	2628	2633	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015661	T	6	6	2648	2653	0 %	100 %	0 %	0 %	336237227
79	NC_015661	TTG	2	6	2706	2711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336237227
80	NC_015661	TTC	2	6	2720	2725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336237227
81	NC_015661	AAT	2	6	2747	2752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336237227
82	NC_015661	TGC	2	6	2771	2776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336237227
83	NC_015661	AT	3	6	2783	2788	50 %	50 %	0 %	0 %	336237227
84	NC_015661	TCG	2	6	2789	2794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336237227
85	NC_015661	ACG	2	6	2815	2820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336237227
86	NC_015661	T	6	6	2821	2826	0 %	100 %	0 %	0 %	336237227
87	NC_015661	ATC	2	6	2863	2868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336237227
88	NC_015661	TTC	2	6	2893	2898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336237227
89	NC_015661	GAT	2	6	2920	2925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336237227
90	NC_015661	TCG	2	6	3020	3025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336237227
91	NC_015661	GCTT	2	8	3113	3120	0 %	50 %	25 %	25 %	336237227
92	NC_015661	TA	3	6	3342	3347	50 %	50 %	0 %	0 %	336237227
93	NC_015661	AC	3	6	3435	3440	50 %	0 %	0 %	50 %	336237227
94	NC_015661	AT	3	6	3491	3496	50 %	50 %	0 %	0 %	336237227
95	NC_015661	CCG	2	6	3542	3547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336237227
96	NC_015661	GCT	2	6	3627	3632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336237227
97	NC_015661	TCT	2	6	3638	3643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336237227
98	NC_015661	CAAT	2	8	3677	3684	50 %	25 %	0 %	25 %	336237227
99	NC_015661	TGG	2	6	3720	3725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336237227
100	NC_015661	T	6	6	3778	3783	0 %	100 %	0 %	0 %	336237227
101	NC_015661	T	6	6	3832	3837	0 %	100 %	0 %	0 %	336237227
102	NC_015661	ACAA	2	8	3856	3863	75 %	0 %	0 %	25 %	336237227
103	NC_015661	TTC	2	6	3872	3877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336237227
104	NC_015661	TTC	2	6	3904	3909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336237227
105	NC_015661	CAA	2	6	3931	3936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336237227
106	NC_015661	A	6	6	3935	3940	100 %	0 %	0 %	0 %	336237227
107	NC_015661	CAA	2	6	3986	3991	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_015661	TAT	2	6	4052	4057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015661	GTG	2	6	4073	4078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015661	GGT	2	6	4080	4085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015661	TG	3	6	4108	4113	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015661	T	6	6	4133	4138	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015661	TC	3	6	4143	4148	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_015661	TCTG	2	8	4151	4158	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_015661	AAG	2	6	4209	4214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015661	TAAT	2	8	4253	4260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015661	T	7	7	4268	4274	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015661	TGC	2	6	4293	4298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_015661	TCCA	2	8	4467	4474	25 %	25 %	0 %	50 %	336237228
120	NC_015661	TCG	2	6	4553	4558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336237228
121	NC_015661	ATC	2	6	4569	4574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336237228
122	NC_015661	CAT	2	6	4609	4614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336237229
123	NC_015661	TCC	2	6	4615	4620	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336237229
124	NC_015661	AG	3	6	4644	4649	50 %	0 %	50 %	0 %	336237229
125	NC_015661	AAG	2	6	4746	4751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336237229
126	NC_015661	CCA	2	6	4895	4900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336237229
127	NC_015661	CAT	2	6	4907	4912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336237229
128	NC_015661	T	6	6	5019	5024	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015661	T	7	7	5042	5048	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015661	ATT	2	6	5061	5066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015661	TAT	2	6	5073	5078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015661	T	6	6	5081	5086	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015661	AT	3	6	5091	5096	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015661	GAAGG	2	10	5151	5160	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015661	GTT	2	6	5194	5199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336237230
136	NC_015661	AGC	2	6	5236	5241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336237230
137	NC_015661	AT	3	6	5244	5249	50 %	50 %	0 %	0 %	336237230
138	NC_015661	CAA	2	6	5272	5277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336237230
139	NC_015661	AT	3	6	5353	5358	50 %	50 %	0 %	0 %	336237230
140	NC_015661	TGA	2	6	5362	5367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336237230
141	NC_015661	A	8	8	5379	5386	100 %	0 %	0 %	0 %	336237230
142	NC_015661	TCC	2	6	5389	5394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
143	NC_015661	T	7	7	5441	5447	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015661	GAT	2	6	5539	5544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015661	A	7	7	5552	5558	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015661	TTTTA	2	10	5582	5591	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015661	GTA	2	6	5639	5644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015661	GAT	2	6	5701	5706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015661	TGAT	2	8	5863	5870	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_015661	TGTA	2	8	5878	5885	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_015661	AT	3	6	5900	5905	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_015661	T	7	7	5981	5987	0 %	100 %	0 %	0 %	336237231
153	NC_015661	CTTTT	2	10	5990	5999	0 %	80 %	0 %	20 %	336237231
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155	NC_015661	T	7	7	6045	6051	0 %	100 %	0 %	0 %	336237231
156	NC_015661	TACT	2	8	6099	6106	25 %	50 %	0 %	25 %	336237231
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161	NC_015661	T	6	6	6245	6250	0 %	100 %	0 %	0 %	336237231
162	NC_015661	TAC	2	6	6268	6273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336237231
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169	NC_015661	T	7	7	6450	6456	0 %	100 %	0 %	0 %	336237231
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176	NC_015661	TTTA	2	8	6625	6632	25 %	75 %	0 %	0 %	336237232
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189	NC_015661	ATC	5	15	7569	7583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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193	NC_015661	TCA	2	6	7663	7668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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282	NC_015661	T	6	6	11185	11190	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
283	NC_015661	T	6	6	11275	11280	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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286	NC_015661	AGA	2	6	11312	11317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
287	NC_015661	GAA	2	6	11345	11350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
288	NC_015661	CTTT	2	8	11398	11405	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
289	NC_015661	AAAGG	2	10	11419	11428	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
290	NC_015661	CAAA	2	8	11447	11454	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
291	NC_015661	AAT	2	6	11470	11475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_015661	CTC	2	6	11529	11534	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
293	NC_015661	T	7	7	11580	11586	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
294	NC_015661	AAAAAT	2	12	11595	11606	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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297	NC_015661	CAG	2	6	11795	11800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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306	NC_015661	A	6	6	12263	12268	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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309	NC_015661	T	7	7	12304	12310	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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323	NC_015661	T	6	6	12729	12734	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
324	NC_015661	A	7	7	12846	12852	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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422	NC_015661	TCA	2	6	17172	17177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336237244
423	NC_015661	CTT	2	6	17279	17284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336237244
424	NC_015661	TTC	2	6	17285	17290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336237244
425	NC_015661	AATC	2	8	17312	17319	50 %	25 %	0 %	25 %	336237244
426	NC_015661	CGC	2	6	17325	17330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336237244
427	NC_015661	TCG	2	6	17340	17345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336237244
428	NC_015661	TCG	2	6	17371	17376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336237244
429	NC_015661	GAA	2	6	17378	17383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336237244
430	NC_015661	GC	3	6	17429	17434	0 %	0 %	50 %	50 %	336237244
431	NC_015661	CG	3	6	17484	17489	0 %	0 %	50 %	50 %	336237244
432	NC_015661	CTT	2	6	17491	17496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336237244
433	NC_015661	GCA	2	6	17535	17540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336237244
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436	NC_015661	TCA	2	6	17766	17771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336237244
437	NC_015661	TCT	2	6	17781	17786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336237244
438	NC_015661	TCA	2	6	17848	17853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336237244
439	NC_015661	T	6	6	17856	17861	0 %	100 %	0 %	0 %	336237244
440	NC_015661	AAT	2	6	17897	17902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336237244
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442	NC_015661	CTT	2	6	18070	18075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336237244
443	NC_015661	AGCT	2	8	18101	18108	25 %	25 %	25 %	25 %	336237244
444	NC_015661	TGAT	2	8	18117	18124	25 %	50 %	25 %	0 %	336237244
445	NC_015661	GTCC	2	8	18145	18152	0 %	25 %	25 %	50 %	336237244
446	NC_015661	T	6	6	18254	18259	0 %	100 %	0 %	0 %	336237244
447	NC_015661	TTCT	2	8	18275	18282	0 %	75 %	0 %	25 %	336237244
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451	NC_015661	CCAT	2	8	18505	18512	25 %	25 %	0 %	50 %	336237244
452	NC_015661	TGTA	2	8	18517	18524	25 %	50 %	25 %	0 %	336237244
453	NC_015661	TGC	2	6	18537	18542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336237244
454	NC_015661	TGAA	2	8	18552	18559	50 %	25 %	25 %	0 %	336237244
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463	NC_015661	TGAT	2	8	18951	18958	25 %	50 %	25 %	0 %	336237244
464	NC_015661	ATC	2	6	18990	18995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336237244
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469	NC_015661	AG	3	6	19112	19117	50 %	0 %	50 %	0 %	336237244
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475	NC_015661	CCT	2	6	19585	19590	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
476	NC_015661	TAA	2	6	19605	19610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
477	NC_015661	ATA	3	9	19618	19626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding